ПРО СТРУКТУРУ НАБОРУ ДАНИХ ДЛЯ ТРЕНУВАННЯ ГЕНЕРАТИВНИХ НЕЙРОННИХ МЕРЕЖ У ДИЗАЙНІ БІЛКІВ
DOI:
https://doi.org/10.30888/2663-5712.2024-28-00-016Ключові слова:
Нейронна мережа, дата-сет, структура даних, координати атомів, вирівнювання координатАнотація
У роботі розглядаються шляхи нормалізації набору даних, який може бути використаний для навчання нейронних мереж, що застосовуються для дизайну білків або інших великих органічних молекул, що володіють складною структурою. Розглянуто шляхи трансляційногоMetrics
Посилання
Hou, Q., Waury, K., Gogishvili, D., Feenstra, K.A. Ten quick tips for sequence-based prediction of protein properties using machine learning // PLoS Computational Biology. — 2022. — Т. 18, №12. — e1010669. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010669.
Shindyalov, I.N., Bourne, P.E. Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path // Protein Engineering, Design and Selection. — 1998. — Т. 11, №9. — С. 739–747. DOI: https://doi.org/10.1093/protein/11.9.739.
Blay, V., Pei, D. Serine proteases: how did chemists tease out their catalytic mechanism? // ChemTexts. — 2019. — Т. 5. — С. 19. DOI: https://doi.org/10.1007/s40828-019-0093-4.
Falkenstein, P., Zhao, Z., Di Pede-Mattatelli, A., Künze, G., Sommer, M., Sonnendecker, C., Zimmermann, W., Colizzi, F., Matysik, J., Song, C. // ACS Catalysis. — 2023. — Т. 13, №10. — С. 6919-6933. DOI: https://doi.org/10.1021/acscatal.3c00259.
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2024 Автори
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.
